La soprano Jacquelyn Wagner naît près de Détroit, aux Etats-Unis, en 1981 dans une famille de musiciens (son père est corniste au sein de l'Orchestre symphonique de Détroit). Elle étudie le chant à la Manhattan School of Music et à l'Université Oakland du Michigan, aux Etats-Unis. Dès 2006, elle prend le rôle de Fiordiligi dans Cosi fan Tutte à Genève. Elle intègre ensuite la troupe de l'Opéra Allemand de Berlin dès l'année 2008. Son répertoire favori s'y profile déjà : elle y chante Pamina dans La Flûte enchantée, la Comtesse dans Les Noces de Figaro ou encore Musette dans La Bohème.

En 2009, elle prend le rôle de Donna Anna dans Don Giovanni à Lyon, et débute à Amsterdam dans Cosi fan tutte, obtenant un grand succès. Ses prises de rôles se succèdent : elle est Rosalinde dans La Chauve-souris de Strauss à Strasbourg et Agathe dans le Freischütz à Toulon en 2011, puis elle fait ses débuts à l'Opéra de Francfort en chantant Violetta dans La Traviata en 2012. Elle retourne dans son pays natal pour prendre le rôle-titre d’Arabella (Strauss) à l'Opéra du Minnesota en 2013. L'année suivante, elle retrouve Don Giovanni, mais cette fois en Donna Elvira à Toulon. 

En 2015, la soprano débute à l’Opéra national de Paris dans La Flûte Enchantée mise en scène par Robert Carsen et prend le rôle de Vitellia dans La Clémence de Titus à Strasbourg. En 2016, elle s'élance dans le répertoire wagnérien en prenant le rôle de Gutrune dans Le Crépuscule des Dieux au Liceu de Barcelone, puis elle incarne Desdemona dans Otello au Deutsche Oper am Rhein. En 2017, elle chante Mrs Alice Ford dans Falstaff de Verdi à Amsterdam, puis s'empare du rôle d'Eva dans Les Maîtres chanteurs de Nuremberg pour ses débuts à La Scala de Milan. En 2018, elle chante Florestan dans Fidelio au Théâtre Saint-Gall en Suisse, puis prend le rôle de la Maréchale dans Le Chevalier à la rose au Deutsche Oper am Rhein, ainsi que le rôle-titre d'Euryanthe de Weber au Théâtre de la Vienne. Elle retrouve son homonyme wagnérien en 2019 au Théâtre d'État de Salzbourg avec sa prise du rôle d'Elsa dans Lohengrin. En 2020, elle chante le rôle-titre d'Alcina au Deutsche Oper am Rhein. 

En 2020/2021, Jacquelyn Wagner chantera le rôle d'Agathe dans le Freischütz à Hambourg en avril et à Dresde en mai.